Segundo historiadores, a adoção do nome de Rio do Antônio foi inspirado no rio de mesmo nome que percorre a região. Há ainda, a lenda de que teria sido conferido ao lugar o prenome de Antônio Cunha, voluntário que partiu dali para a Guerra do Paraguai, de onde não voltou.
Os primeiros habitantes surgiram no ano de 1874, na fazenda do Senhor Bernardo José Dias, onde o mesmo, com seus filhos, construiu uma capela em louvor a Nossa Senhora do Livramento, que atualmente é a Padroeira do município. Formou-se um povoado e como situava-se próximo à fazenda do nativo Antônio, e na referida fazenda, passava-se um rio, denominou-se assim, o povoado de Rio do Antônio.
Em ocasiões mais tarde passou-se a vila de Rio do Antônio, com a administração pública e a jurisprudência, pertenceu ao município vizinho de Caculé. E só concretizada a sua emancipação política e oficializada em 27 de julho de 1962, publicado no Diário Oficial do estado da Bahia em 1 de agosto do mesmo ano, pela lei n° 1759.