O povoado de Lagoa Real se formou no século XIX em fazenda de mesmo nome, anteriormente pertencente ao latifúndio da Casa da Ponte.
O povoado foi elevado à categoria de freguesia, dentro da cidade de Caetité, por meio da Lei Provincial nº 2.211, de 16 de julho de 1881.
Um importante episódio da história lagoa-realense foi a passagem da Coluna Prestes que, evitando a sede municipal de Caetité, atacou o então distrito.
Na década de 1980, a população de Lagoa Real, na época um dos distritos mais importantes de Caetité, mobilizou-se em uma associação pela emancipação, obtida por meio da Lei Estadual n° 5025, de 13 de junho de 1989.