A região de Igaporã foi colonizada no século XVIII, no contexto do povoamento do Alto Sertão Baiano, no qual o município está localizado.
Em 1871, foi erguida uma capela em louvor a Nossa Senhora do Livramento, ao redor da qual se formou a povoação de Bonito (atual cidade de Igaporã), elevada à categoria de freguesia de Caetité por meio da Lei provincial nº 2438, de 1° de maio de 1884. Posteriormente, o distrito de Bonito teria seu nome alterado para Igaporã (termo oriundo do tupi-guarani cujo significado é rio bonito) pelo Decreto-lei estadual nº 141, de 31 de dezembro de 1943, confirmado pelo Decreto estadual nº 12.978, de 1° de junho de 1944.
A Lei estadual nº 556, de 25 de maio de 1953, elevou Igaporã à categoria de município, tendo como primeiro prefeito Orozimbo Ribeiro. No entanto, nos anos seguintes, houve disputas judiciais sobre a emancipação do município, resultando em um acórdão do STF de 26 de outubro de 1956, no qual a emancipação de Igaporã foi declarada inconstitucional, retornando o município à categoria de distrito de Caetité. Posteriormente, a Lei estadual nº 1030, de 14 de agosto de 1958, restaurou a autonomia do município de Igaporã, instalado em 7 de abril de 1963.